El Servicio de Microbiología y la Unidad de Investigación del Hospital Universitario Son Espases y el Instituto de Investigación Sanitaria Illes Balears (IdISBa) han publicado un estudio sobre la predicción de fenotipos de susceptibilidad de Pseudomonas aeruginosa a partir del análisis del resistoma de la secuencia del genoma completo. También ha participado el Grupo de Estudio de Pseudomonas GEMARA-SEIMC/REIPI.
Sara Cortes-Lara
, Ester Del Barrio-Tofiño, Carla López-Causapé y Antonio Oliver, microbiólogos del Hospital Universitario Son Espases e investigadores del IdISBa, han participado en la publicación del artículo con el título "Predicting Pseudomonas aeruginosa susceptibility phenotypes from whole genome sequence resistome analysis" en la revista Clinical Microbiology and Infection.
El objetivo era desarrollar y validar una puntuación de resistencia genotípica de Pseudomonas aeruginosa, basada en el análisis del resistoma de la secuencia del genoma completo, para predecir los fenotipos de susceptibilidad antimicrobiana.
Se desarrolló un sistema de puntuación basado en el análisis de la resistencia impulsada por mutaciones en 40 genes cromosómicos y la resistencia adquirida horizontalmente (Resfinder) para ceftazidima, ceftolozane/tazobactam, meropenem, ciprofloxacina y tobramicina. Los genes/mutaciones de resistencia se puntuaron de 0 (sin efecto) a 1 (resistencia clínica EUCAST). Se secuenciaron completamente 100 cepas de tipo salvaje obtenidas de 51 hospitales diferentes durante un estudio multicéntrico de 2017 y se analizaron para definir un catálogo de polimorfismos naturales en los 40 genes de resistencia cromosómica. La capacidad de la puntuación genotípica para predecir el fenotipo de susceptibilidad se probó en 204 aislados seleccionados al azar de los 51 hospitales (4 de cada hospital).
Aunque en este estudio de prueba de concepto se evidenció un margen de mejora, se documentó una buena correlación general entre la puntuación de resistencia genotípica y el perfil de susceptibilidad. Es necesario seguir perfeccionando el sistema de puntuación, automatizarlo y probarlo en grandes cohortes internacionales.
Referencia del artículo
Cortes-Lara S, Barrio-Tofiño E del, López-Causapé C, Oliver A, Martínez-Martínez L, Bou G, et al. Predicting Pseudomonas aeruginosa susceptibility phenotypes from whole genome sequence resistome analysis. Clin Microbiol Infect. Mai 2021. doi: 10.1016/j.cmi.2021.05.011. PubMed PMID:34015532.Enlaces Bibliosalut |
Altmetric [Fuente: Bibliosalut]
[Foto: Hospital Universitari Son Llàtzer]
