Categoría: Estudios y proyectos

El uso de la técnica de sobremuestreo en la imagen por espectrometría de masas-MALDI permite definir el lipidoma en resoluciones subcelulares

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El Instituto de Investigación Sanitaria Illes Balear (IdISBa) ha publicado un estudio que confirma que se puede llegar a una resolución subcelular si se utiliza la técnica llamada sobremuestreo (oversampling) durante los experimentos de imagen por espectrometría de masas-MALDI. En este estudio, ha sido fundamental la colaboración con el Grupo de Espectroscopía y Espectrometria de Masas de la Universitat del País Basc, donde también ha participado la Technische Universität Berlin.

Albert Maimó-Barceló, Joan Bestard-Escalas, Luzie Berthold, Daniel H. Lopez y Gwendolyn Barceló-Coblijn, investigadores del IdISBa y miembros del Grup Lipids in Human Pathology, han publicado el artículo con el título "Confirmation of sub-cellular resolution using oversampling imaging mass spectrometry" en la revista Analytical and Bioanalytical Chemistry.

El uso de la técnica de sobremuestreo (oversampling) con el objetivo de mejorar la resolución lateral es una práctica común dentro del ámbito de la imagen por espectrometría de masas-MALDI (matrix-assisted laser desorption/ionization). Aun así, su aplicación es aún controvertida y estudios recientes muestran ciertos cambios en la intensidad relativa de los espectros en función de la medida del láser. En estudios anteriores donde utilizaremos el sobremuestreo, no solo se pudieron describir el lipidoma del epitelio de colo humano, una monocapa celular de 20–30 μm, incluso evaluar los cambios producidos en ella durante procesos biológicos complejos como la diferenciación o la malignización. Curiosamente, el análisis por K-means de estos datos reveló la presencia de un tercer clúster en el epitelio que coincidía anatómicamente con la posición del núcleo es de 9–12 μm de diámetro y su lipidoma característico, se decidió comprobar si realmente este clúster era de origen nuclear. Por eso, se comparan los espectros obtenidos del análisis directo de las secciones de colon con los obtenidos de núcleos aislados por métodos de centrifugación diferencial. El coeficiente de correlación más alto se obtuvo cuando se compararon los espectros de los núcleos aislados con el supuesto clúster de núcleos en el tejido, el que demuestra que se había identificado correctamente el lipidoma nuclear en aquellos experimentos de MALDI-IMS hechos utilizando la técnica de sobremuestreo y una resolución lateral de 10 μm/píxel. Además, también fue importante observar que los niveles nucleares de fosfatidilinositol 38:4 se mantenían estables al largo de la cripta. Es decir, no reproducían ni la disminución regular observada en el epitelio ni el aumento regular observado en el estroma, eliminando la posibilidad de contaminación entre píxeles. En conjunto, a demás de confirmar la utilidad de la técnica de sobremuestreo, estos resultados refuerzan claramente el papel fundamental que puede tener la imagen por espectrometría de masas-MALDI en campos tan prometedores como el del análisis célula a célula (single-cell analysis).

Referencia del artículo
Maimó-Barceló A, Garate J, Bestard-Escalas J, Fernández R, Berthold L, Lopez DH, et al. Confirmation of sub-cellular resolution using oversampling imaging mass spectrometry. Anal Bioanal Chem. 19 nov 2019. doi: 10.1007/s00216-019-02212-3. PubMed PMID: 31745610.

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[Fuente: Bibliosalut]

[Foto: Hospital Universitari Son Espases]

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