El Grup Lipids en Patologia Humana de l'Institut d'Investigació Sanitària Illes Balears (IdISBa), ha participat en un estudi de prova de concepte en el qual s'investiga el rebuig dels al·loempelts renals emprant tècniques de transcriptòmica amb resolució espacial.
Ramón Mª Rodríguez
(autor sènior) i Gwendolyn Barceló-Coblijn, (autora col·laboradora), ambdós investigadors de l'IdISBa, ha participat en la publicació de l'article amb el títol "Exploring kidney allograft rejection: A proof-of-concept study using spatial transcriptomics" a la revista American Journal of Transplantation.
En aquest estudi, es combinaren dades de transcriptòmica espacial combinada amb dades públiques de seqüenciació d'ARN de cèl·lules individuals per explorar el potencial d'aquesta tecnologia a l'hora d'estudiar el rebuig d'al·loempelts renals. Mitjançant l'anàlisi de biòpsies classificades com no rebuig, rebuig agut mediat per cèl·lules T i fibrosi intersticial i atròfia tubular (IFTA), l'objectiu era descriure els patrons d'expressió gènica de diversos estats patològics emprant tècniques amb resolució espacial. Els resultats revelen l'organització espacial a l'interstici renal dels diferents tipus de cèl·lules immunitàries, incloses les dels limfòcits T i B, monòcits, mastòcits i cèl·lules plasmàtiques, així com una firma transcriptòmica pròpia i diferencial. També es descrigueren la distribució espacial dels receptors i lligands de quimiocines per estudiar la migració i el reclutament de cèl·lules immunitàries.
Finalment, l'anàlisi demostra un enriquiment espacial diferencial de les firmes de transcripció associades al rebuig de l'al·loempelt renal a diverses regions de la biòpsia. Les regions de l'interstici mostraren puntuacions d'enriquiment més altes per als patrons d'expressió gènica associats al rebuig que les àrees tubulars, que obtingueren puntuacions negatives. Això implicaria que aquestes firmes transcriptòmiques venen principalment determinades pels processos que es desenvolupen a l'interstici renal.
Així doncs, aquest estudi destaca el valor de la transcriptòmica espacial en el moment de revelar l'heterogeneïtat cel·lular i les firmes immunitàries en biòpsies de trasplantament renal, i demostra el seu potencial per estudiar els mecanismes moleculars i cel·lulars associats al rebuig. No obstant això, cal tenir en compte certes limitacions pel que fa al desenvolupament i les futures aplicacions d'aquesta tecnologia.
Referència de l'article
Martin-Martin C, Suarez-Alvarez B, González M, Torres IB, Bestard O, Martín JE, et al. Exploring kidney allograft rejection: A proof-of-concept study using spatial transcriptomics. Am J Transplant. 2024 Apr 29. doi: 10.1016/j.ajt.2024.04.015. PubMed PMID: 38692412.Enllaços Bibliosalut
Mètriques
 Altmetric |
[Font: Bibliosalut]
[Foto: Roboonya / Chronic CNI toxicity in renal allograft / CC BY-NC - Gwendolyn Barceló]
