El Laboratori d'Investigació d'Epigenètica del Càncer de l'IdISBa genera un mapa de l'estructura tridimensional del genoma del càncer mamari triple negatiu

Aquests models establerts en el Laboratori d'Epigenètica del Càncer de l'IdISBa han servit de base per a la confecció de mapes epigenètics (modificacions de l'ADN i estructura del genoma) i transcriptómics (avaluació de l'expressió de tots els gens actius del genoma) d'aquesta mena de tumor agressiu.

Amb la publicació d'aquests mapes, que seran de domini públic i podran ser utilitzats com a guia per a innombrables recerques, es posa a l'abast de tota la comunitat científica les dades de diverses tècniques de seqüenciació.

Per a aquest fi s'ha triat el repositori del European Nucleotide Arxivi (Array Express: E-MTAB-12825). A més, els detalls i guies per a la seva utilització han estat publicats aquesta setmana en la revista de dades genòmiques BMC Genomics Data, el podeu consultar al repositori institucional Docusalut.

El projecte, dirigit pel Dr. Diego Marzese i principalment executat en la part funcional pel Dr. Pere Llinas-Arias i en la part de biologia computacional per Miquel Ensenyat-Méndez, tots investigadors de l'IdISBa, ha comptat amb la col·laboració d'experts en tractament del càncer mamari com els Drs. Javier Orozco (SJHC, EUA) i Maggie DiNome (Duke University, EUA), d'experts en epigenètica com els Drs. Mathieu Lupien (Princess Margaret, Canadà) i Manel Esteller (IJC, Barcelona) i d'investigadors de centres avançats d'anàlisi genòmica (Karolinska Institutet i NGI, Suècia).

Aquest estudi forma part d'un projecte, actualment desenvolupat a l'IdISBa, que ha descobert que la modulació epigenètica d'una regió genètica en aquests tumors permet la invasió de teixits sans, que actualment es troba en vies de publicació i s'ha dipositat en un repositori públic com preprint.

[Font: IdISBa. 17/11/2023]

[Foto: @ondasderuido / DNA / CC BY-SA 2.0]