El Servei de Salut disposa d'un pressupost d'1.362,87 M€, que té com a objectiu principal ajustar-se a la realitat i posar fi al tradicional dèficit que presenta a conseqüència d'una històrica infradotació pressupostària. Aquesta xifra, presentada en el marc del projecte de pressupostos de la Comunitat Autònoma, suposa un increment per 2016 d'un 5,62 % (72,5 M€ més que en 2015), ja que passa de 1290,37 a 1362,87 M€ per al proper exercici. Aquest augment és encara superior, ja que 45 M€ del pressupost inicial de 2015 es van destinar directament al pagament de deute a principis de gener, fet que va deixar el pressupost en 1.244 M€. Aquests 1.362,87 M€ es destinaran a la millora dels serveis sanitaris d'acord amb els principis d'universalitat, accessibilitat, eficiència i qualitat, el més ajustat a la despesa real.
A diferència d'anys anteriors, els pressupostos de 2016 eliminen la taxa per renovar la targeta sanitària, ja que serà gratuïta a partir de gener.